PočetnaOstaloTechKonzorcij računalnih tehnologija visokih performansi usmjerio je resurse svojih super računala na...

Konzorcij računalnih tehnologija visokih performansi usmjerio je resurse svojih super računala na istraživanje COVID-19


U partnerstvu s Uredom za znanost i tehnologiju Bijele kuće (OSTP), IBM je još u ožujku najavio da će pomoći u koordinaciji napora kako bi se resursi super računala od stotina petaflopsa pružila znanstvenicima koji istražuju novi koronavirus. Kao dio novoosnovanog konzorcija COVID-19 za računalstvo visokih performansi (HPC), IBM se obvezao da će pomoći u procjeni prijedloga i pružiti pristup resursima za projekte koji „imaju direktan utjecaj“ na istraživanja cjepiva i lijekova za COVID-19.

Nakon jesenskog povećanja slučajeva COVID-19 širom svijeta, uključujući i SAD, članovi organizacije kažu da je projekt sada ušao u novu fazu i da će se usredotočiti na pružanje svojih resursa za pacijente pogođene virusom. Konzorcij namjerava usmjeriti svoj fokus na istraživanja s većim potencijalom za pozitivne ishode na pacijentima u roku od slijedećih šest mjeseci.

Članovi konzorcija kažu da je prijelaz djelomično motiviran većim brojem podataka o COVID-19 koji su sada dostupni, što omogućuje veću pomoć pacijentima nego na početku pandemije kada se baratalo s vrlo malim brojkama. Ubuduće, Konzorcij će biti posebno – iako ne isključivo – zainteresiran za projekte koji modeliraju odgovore na virus pomoću kliničkih skupova podataka, potvrđuju modele odgovora na cjepiva iz više kliničkih ispitivanja, ocjenjuju kombinirane terapije korištenjem prenamijenjenih molekula i razvijaju epidemiološke algoritme vođene multi-modalnim skupovima podataka.

Konzorcij – čija su 43 člana IBM, Amazon, Microsoft, Nvidia, Intel, Google i Nacionalni laboratorij Oak Ridge američkog Ministarstva energetike – već je primio više od 175 prijedloga za istraživanje od istraživača u preko 15 zemalja. Kombinirani računalni kapacitet grupe narastao je sa 330 petaflopsa (330 bilijuna operacija u sekundi), u ožujku na 437 petaflopsa u svibnju i 600 petaflopsa danas, uz pomoć otprilike 6,8 milijuna procesorskih jezgri i 50 000 grafičkih kartica.

Moćna računala omogućuju istraživačima da izvrše velike količine proračuna u epidemiologiji, bioinformatici i molekularnom modeliranju, izračuni koji bi na tradicionalnim računalnim platformama mogli potrajati mjesecima (ili godinama ako se rade ručno). Štoviše, budući da su računala dostupna u oblaku, omogućuju timovima suradnju s bilo kojeg mjesta na svijetu.

Uvidi stvoreni eksperimentima mogu pomoći unaprijediti naše razumijevanje ključnih aspekata COVID-19, kao što su virusno-ljudska interakcija, virusna struktura i funkcija, dizajn malih molekula, prenamjena lijeka i putanja i ishodi pacijenta. Odobrene akademske i neprofitne istraživačke institucije dobivaju besplatan pristup računalnim resursima Konzorcija. (Prema IBM-u, petaflop računalne snage košta između 2 i 3 milijuna USD.)

Konzorcij tvrdi da je do danas podržao više od 91 istraživački projekt, uključujući pomoć timu sa Državnog sveučilišta Utah koji je simulirao dinamiku aerosola u zatvorenom prostoru i otkrio da se kapljice iz disanja zadržavaju duže u zraku nego što se do tada pretpostavljalo.

Istraživači s Državnog sveučilišta u Michiganu koristili su proračunsku snagu Konzorcija kako bi provjerili podatke s oko 1600 lijekova odobrenih od strane FDA kako bi utvrdili postoje li kombinacije koje bi mogle pomoći u liječenju COVID-19.

Studija indijske Novel Techsciences analizirala je prirodne spojeve biljnog podrijetla iz 55 ljekovitih biljaka kako bi identificirala spojeve s antivirusnim svojstvima koji bi se mogli koristiti protiv osam proteina SARS-CoV-2. I par NASA-inih istraživača rade na definiranju rizičnih skupina izvođenjem analize genoma na pacijentima s COVID-19 koji razviju sindrom akutnog respiratornog stresa.

Piše: Z.K.


RELATED ARTICLES

Komentiraj

Please enter your comment!
Please enter your name here

- Advertisment -

Most Popular